Striking Distance Studios, The Callisto Protocol için bazı sahneleri çıkarmadan derecelendirilmeyeceğini öğrendikten sonra Japonya’daki çıkışını iptal etti. Oyunun resmi Twitter hesabında, “The Callisto Protocol’ün Japon versiyonunu durdurmaya karar verdik. Oyunun güncel haliyle CERO derecelendirmesinden geçemeyeceğini ve içeriğinin değiştirilmesi ile oyuncuların istedikleri deneyimi yaşamayacaklarına karar verdik. Japonya’daki tüm oyuncuların anlayışı için teşekkür ederiz.” açıklaması yapıldı. Ayrıca, ön sipariş yapan oyunculara geri ödemelerin yapılacağı bilgisi de verildi. 

Japonya’da video oyunları nadiren tamamen yasaklanır ancak Gears of War, Call of Duty, Grand Theft Auto ve Dead Island gibi oyunlar Japonya’daki çıkışları için aşırı şiddet öğelerini tekrar düzenlemişlerdi.